1.基因转化技术在小麦遗传育种中的应用。

　　大多数转基因方法已被证明均可用于小麦基因转多。效果最好的转基因方法是基因枪法。转基因技术在小麦中应用十分广泛，主要应用在抗病、虫害、抗除草剂、改良小麦品质等方面。

　　到目前为止，小麦基因转化的目标基因和选择（标志）基因主要有报告基因类的GUS、CAT和LUC；抗抗生素类的NptⅡ、Hpt和抗除草剂类的Bar、EPSPs、Bxn、CP4和GOX。这些基因在小麦上的利用主要是建立有效的遗传转化系统。至今，已经导入小麦并在转基因植株中得到表达的目标基因主要有：改良小麦加工品质方面的基因，如：高分子量谷蛋白亚基（HMW）基因1Ax、1、1Dx5、1Dx10和重组高分子量谷蛋白亚基基因（GLPs）、水稻蛋白基因（TLP）、藜芦醇合成酶基因、大麦种子核糖滞活蛋白（RIP）基因和玉米Ds转座子；嵌合雄性不育类基因，如：细胞骨架蛋白基因和核糖核酸酶类基因等；抗除草剂类基因，如Bar、EPSPs、Bxn、CP4和GOX。目前，在转基因小麦中应用得最多的选择基因还是抗除草剂基因Bar。

　　2.分子标记技术在小麦遗传育种上的应用。

　　随着分子生物学的发展，开发了一类基于DNA变异的分子标记。目前，已开发了多种分子标记，主要有：限制性片段长度多态性（RFLP）、随机扩增多态DNA（RAPD）、扩增片段长度多态性（AFLP）、简单序列重复（SSP）、序列特异扩增区域（SCAR）、序列标定位点（STS）、单链构象多态性（SSCP）、单核苷酸多态性（SNP）和数量可变串联重复（VNTR）等。分子标记直接以DNA形式表现，不受环境条件和发育阶段的影响，标记的数目多、多态性高。有许多分子标记表现为共显性，能提供完整的遗传信息。分子标记可用于分子图谱构建、基因定位、DNA指纹库建立、鉴定与标记（外源）染色体片段、小麦遗传关系的研究、辅助育种等。在小麦遗传育种研究中应用较多的是RFLP、RADP、SSR、STS、AFLP等。

　　目前已建立了小麦B组和D组及黑麦和一些山羊草染色体的理想指纹图谱。在小麦多个抗叶锈基因上已建立了紧密连锁的分子标记，一些标记已经转换为PCR基础上的STS、SCAR标记。